Penyakit Busuk Pangkal Batang (BPB) akibat jamur Ganoderma boninense menjadi ancaman serius bagi industri kelapa sawit karena bersifat asimtomatik pada fase awal. Skripsi ini merancang sistem deteksi dini non-destruktif berbasis citra termal menggunakan arsitektur Hybrid CNN-Transformer untuk mengklasifikasikan tingkat keparahan infeksi ke dalam 5 kelas (SEHAT, Scoring 1-4), dengan hasil akurasi global sebesar 72,66%. Hasil klasifikasi ini diintegrasikan dengan Sistem Pendukung Keputusan (SPK) berbasis Fuzzy Mamdani yang secara otomatis menghasilkan rekomendasi tindakan penanganan (monitoring, pengendalian intensif, atau eradikasi) sesuai tingkat keparahan. Seluruh sistem diimplementasikan dalam bentuk dashboard web terintegrasi untuk mendukung pemantauan sebaran Ganoderma di perkebunan kelapa sawit secara real-time.